- Sou: 44.970 euros bruts/anuals
- Contacte de 2-3 referencies.
¿Quiénes somos?
El Instituto de Investigación Germans Trias i Pujol (IGTP) es un centro de investigación público situado en Badalona (Barcelonés) que tiene como objetivo principal incrementar el conocimiento científico para transformarlo en soluciones para mejorar la salud y atención médica de los pacientes y de la comunidad.
DESCRIPCIÓN DE LA OCUPACIÓN
El Grup de REcerca Neuromuscular de Badalona (GRENBA) del Institut de Recerca Germans Trias i Pujol (IGTP) i ubicat en el àrea de recerca en neurociències, busca un/a bioinformàtic/a sènior amb experiència sòlida en anàlisi de dades massives de seqüenciació del DNA aplicada a la recerca biomèdica i capacitat de lideratge en gestió de projectes . Es busca, un/a científic/a altament motivat amb gran interès en el camp de la genètica i en el camp de les malalties minoritàries .
Aquest/a candidat/a s’incorporará en el grup GRENBA , un grup multidisciplinar i dinàmic integrat per investigadors fundamentals i clínics del IGTP i del Hospital Germans Trias i Pujol ( HGTiP ).
FUNCIONES
La funció principal de la persona que s'incorpori serà posar a punt i analitzar els resultats de la seqüenciació de tercera generació a través de Oxford Nanopore Technologies per:
- Planificació, realització i execució de experiments d’investigació
- Anàlisi, interpretació i presentació de resultats d’investigació
- Contribució a informes d’investigació i publicacions
- Revisió de la literatura científica i desenvolupament de noves idees
- Demanar i gestionar projectes d’investigació
Altres tasques a realitzar seran tasques bioinformàtiques en relació a altres línies de recerca del grup.
SE REQUIERE
Requistis imprescindibles
- Doctorat en el àrea de ciències o de la salut i tecnologies de seqüenciació
- Experiència post doctoral d'almenys 5 anys en aquest camp
- Experiència treballant amb anàlisis de dades massives de seqüenciació del DNA i de seqüenciació de tercera generació de lectures llargues com Oxford Nanopore Tecnologies o PacBio.
- Experiència prèvia en tractament de dades en entorns HPC (Slurm, SGE, etc) i gestió de entorns d’analisi i manteniment d’entorns de treball utilitzant Bash, Python, Snakemake, Nextflow o similars.
Requisits valorables
- Es valorara positivament experiència prèvia en DM1 i molt positivament en anàlisi de caracterització de repeticions utilitzant seqüenciació de lectura llarga.
- Es valorara positivament la experiència prèvia en anàlisi de RNA-seq, de single-cell, de splicing i de epigenòmica.
- Es valorara positivament l’experiència en gestió de projectes i col·laboracions amb hospitals i entorns clínics i publico-privades.
- Es valorara positivament les habilitats d’anàlisi estadístiques de dades clíniques de pacient
- Es valorara molt positivament tenir coneixement i experiència prèvia en aplicació de intel·ligència artificial o aprenentatge màquina en eines de diagnòstic o estratificació de pacients basats en dades òmiques i moleculars.